別々の開発コンソールで1台のobnizを使う方法はありますか？

プログラムから利用するだけであれば、アクセストークンさえ発行されていなければそれぞれのユーザーのプログラムからの利用が可能です。
ただ、２つのアカウントのデバイス管理画面に同じobnizを表示して管理することはできません。